Interpretacja indywidualna – stanowisko prawidłowe

Szanowni Państwo,

stwierdzam, że Państwa stanowisko w sprawie oceny skutków podatkowych opisanego zdarzenia przyszłego w podatku od towarów i usług jest prawidłowe.

Zakres wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej

31 marca 2025 r. wpłynął Państwa wniosek z 31 marca 2025 r. o wydanie interpretacji indywidualnej, który dotyczy prawa do odliczenia podatku VAT od wydatków związanych z realizacją pięciu projektów w ramach (…). Uzupełnili go Państwo pismem z 7 kwietnia 2025 r. (data wpływu 7 kwietnia 2025 r.) oraz w odpowiedzi na wezwanie pismem z 7 maja 2025 r. (data wpływu 7 maja 2025 r.). Treść wniosku jest następująca:

Opis zdarzenia przyszłego

A. (dalej również „A” lub „Wnioskodawca”) jest szkołą wyższą (uczelnią publiczną). A.  jest podatnikiem zarejestrowanym jako podatnik VAT czynny oraz jest zobowiązany do przesyłania dla celów podatku od towarów i usług (VAT) plików JPK_V7M za okresy miesięczne.

Wnioskodawca realizuje różnego rodzaju projekty, w których podatek VAT jest:

• niekwalifikowany (tzn. Wnioskodawca ma prawo do odliczenia całości podatku VAT zawartego w fakturach dokumentujących zakupy towarów i/lub usług związanych z danym projektem) lub
• kwalifikowany (tzn. Wnioskodawca nie ma prawa do odliczenia w ogóle podatku VAT zawartego w fakturach dokumentujących zakupy towarów i/lub usług związanych z danym projektem) lub
• częściowo kwalifikowany (tzn. Wnioskodawca nie ma prawa do odliczenia części podatku VAT zawartego w fakturach dokumentujących zakupy towarów i/lub usług związanych z danym projektem).

Opis zdarzenia przyszłego dot. projektów, których dot. przedmiotowy wniosek.

A. realizować będzie do 2028 roku szereg projektów w ramach Programu Operacyjnego (...)

W chwili obecnej A otrzymał z B dofinansowanie na realizację pięciu projektów w ramach (…).

Cele działania (…) to:

• wsparcie projektów ukierunkowanych na innowacyjne badania naukowe o dużym potencjale wdrożeniowym;
• pomoc w osiągnięciu samodzielności naukowej poprzez prowadzenie zespołu badawczego;
• rozwój naukowej współpracy międzynarodowej i współpracy z podmiotami gospodarczymi działającymi w Polsce;
• zwiększenie konkurencyjności polskich wniosków składanych do konkursów ERC.

Projekt 1:

„(…)” – wartość dofinansowania (…) PLN;

Projekt 2:

„(…)” – wartość dofinansowania (…) PLN;

Projekt 3:

„(…)” – wartość dofinansowania (…) PLN;

Projekt 4:

„(…)” – wartość dofinansowania (…) PLN;

Projekt 5:

„(…)” – wartość dofinansowania (…) PLN.

Biorąc pod uwagę powyższe A dokonał oceny możliwości odliczenia podatku VAT w projektach w następujący sposób – z uwagi na pojawienie się potencjału komercjalizacyjnego i zamiaru wykorzystania nabytych towarów i/lub usług do czynności opodatkowanych VAT, oraz również (w niektórych projektach) wykorzystania nabytych do tych projektów towarów i/lub usług do innych czynności, takich jak edukacja i działalność naukowo-badawcza, czyli czynności zwolnione od podatku VAT oraz niepodlegające opodatkowaniu VAT, A uznał, że podatek VAT od nabywanych towarów i/lub usług w ww. projektach, będzie odliczany w całości lub będzie rozliczany według wskaźników VAT (wg prewspółczynnika VAT, o którym mowa w art. 86 ust. 2a ustawy o VAT) i/lub wg struktury sprzedaży, o której mowa w art. 90 ustawy VAT).

Zgodnie z podrozdziałem 3.5 pkt. 1 „Wytycznych dotyczących kwalifikowalności wydatków na lata 2021-2027”, wydanych na podstawie art. 5 ust. 1 pkt 2 ustawy z dnia 28 kwietnia 2022 r. o zasadach realizacji zadań finansowanych ze środków europejskich w perspektywie finansowej 2021-2021 (Dz. U. poz. 1079) i zatwierdzonych przez Ministra Funduszy i Polityki Regionalnej dnia 18 listopada 2022 r., podatek VAT w projekcie, którego łączny koszt jest mniejszy niż 5 mln EUR (włączając VAT), może być kwalifikowany, z zastrzeżeniem pkt 8.

Zgodnie z pkt 8 ww. podrozdziału: „W SZOP (szczegółowym opisie priorytetów programu), regulaminie wyboru projektów lub umowie o dofinansowanie projektu IZ/IP/IW w ramach EFRR/FS/ FST może wyłączyć możliwość kwalifikowania podatku VAT.

Zgodnie z umowami o dofinansowanie ww. projektów zawartymi pomiędzy B, a A „wydatki poniesione na podatek od towarów i usług (VAT) są kwalifikowane. W przypadku uznania podatku VAT za kwalifikowany w ramach projektu, kontrola podwójnego finansowania wydatków w odniesieniu do kosztów podatku VAT, możliwego do odzyskania przez Beneficjenta, będzie dokonywana przez właściwe służby skarbowe”.

Z uwagi na fakt iż wartość każdego z ww. projektów jest niższa niż 5 mln EUR, szczegółowe opisy priorytetów programu ani regulamin wyboru projektów nie wyłączyły możliwości kwalifikowania podatku VAT, a umowy o dofinansowanie projektów zawierają zapisy o kwalifikowalności podatku VAT, A wykazywać będzie we wnioskach o płatność składanych do FNP wydatki ponoszone na zakup towarów i usług w ramach ww. projektów w pełnej wysokości.

Uzupełnienie i doprecyzowanie opisu zdarzenia przyszłego

Faktury dotyczące realizowanych projektów będą wystawiane na A, który będzie nabywcą towarów i/lub usług.

Towary i usługi nabywane w związku z realizacją projektów będą wykorzystywane (w zależności od projektu) do czynności:

a)opodatkowanych podatkiem od towarów i usług (w zakresie dot. działalności komercyjnej), i/lub

b)zwolnionych od podatku od towarów i usług (w zakresie dot. działalności edukacyjnej), i/lub

c)niepodlegających opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług (w zakresie dot. działalności naukowej).

Towary i usługi nabywane w związku z realizacją projektów będą służyły różnym rodzajom działalności i nie ma możliwości przyporządkowania całości kwot podatku naliczonego do poszczególnych rodzajów czynności.

Do obliczenia proporcji wybrany zostanie sposób określenia proporcji wskazany w § 6 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 17 grudnia 2015 r. w sprawie sposobu określania zakresu wykorzystywania nabywanych towarów i usług do celów działalności gospodarczej w przypadku niektórych podatników (t. j. Dz. U. z 2021 r. poz. 999), zwane dalej rozporządzeniem.

Ponadto informują Państwo, że do obliczenie tzw. wskaźnika struktury sprzedaży wybrany zostanie sposób określony w art. 90 ust. 2-10 ustawy o podatku od towarów i usług.

Pytania

1.Czy w oparciu o przedstawione zdarzenie przyszłe A. będzie przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego (w całości lub zgodnie z wyliczonymi wskaźnikami odliczenia VAT) od zakupu towarów i/lub usług w ramach realizowanych projektów?

2.Czy w trakcie realizacji projektów w ramach (…), dokonanie płatności za faktury na rzecz dostawców i/lub usługodawców za ponoszone wydatki związane z tymi projektami, ze środków otrzymanych z B w kwocie brutto (tj. wraz z podatkiem VAT) będzie przesłanką negatywną wymienioną w art. 88 ustawy o podatku od towarów i usług, która Wnioskodawcy nie daje prawa do odliczenia podatku VAT z faktur zakupu?

Państwa stanowisko w sprawie

ad. 1

Zdaniem Wnioskodawcy w oparciu o przedstawione zdarzenie przyszłe A. będzie przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego (w całości lub zgodnie z wyliczonymi wskaźnikami odliczenia VAT) od zakupu towarów i/lub usług w ramach realizowanych projektów.

ad. 2

Dokonanie płatności za faktury na rzecz dostawców i/lub usługodawców za ponoszone wydatki związane z projektami w ramach (…), ze środków otrzymanych z B w kwocie brutto (tj. wraz z podatkiem VAT) nie będzie przesłanką negatywną wymienioną w art. 88 ustawy o podatku od towarów i usług, która Wnioskodawcy nie daje prawa do odliczenia podatku VAT z faktur zakupu.

Uzasadnienie

Zgodnie z art. 5 ust. 1 ustawy o podatku od towarów i usług (dalej również : „ustawy o VAT”), opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług (VAT) podlegają m.in. odpłatna dostawa towarów i usług i odpłatne świadczenie usług na terytorium kraju.

Z kolei art. 7 ust. 1 tej ustawy stanowi, że przez dostawę towarów rozumie się przeniesienie prawa do rozporządzania towarami jak właściciel.

Stosownie natomiast do art. 8 ust. 1 ustawy o VAT, przez świadczenie usług rozumie się każde świadczenie na rzecz osoby fizycznej, osoby prawnej lub jednostki organizacyjnej niemającej osobowości prawnej, które nie stanowi dostawy towarów.

Z brzmienia powołanych przepisów wynika, iż pojęcia dostawy towarów i świadczenie usług na gruncie ustawy o VAT uzupełniają się w tym sensie, iż, co do zasady, czynności podejmowane przez podatników należy uznać za świadczenie usług, o ile nie stanowią one dostawy towarów.

W konsekwencji w związku z faktem, że czynność komercjalizacji wyników badań w postaci udzielenia odpłatnej licencji do wyników badań nie stanowi dostawy towaru, stanowi ona usługę w rozumieniu art. 8 ust. 1 ustawy o VAT.

W świetle art. 15 ust. 1 ustawy o podatku od towarów i usług za podatników uznaje się osoby prawne, jednostki organizacyjne niemające osobowości prawnej oraz osoby fizyczne, wykonujące samodzielnie działalność gospodarczą, o której mowa w ust. 2 bez względu na cel lub rezultat takiej działalności.

Zgodnie natomiast z ust. 6 tej regulacji, nie uznaje się za podatnika organów władzy publicznej oraz urzędów obsługujących te organy w zakresie realizowanych zadań nałożonych odrębnymi przepisami prawa, do realizacji których zostały one powołane, z wyłączeniem czynności wykonywanych na podstawie zawartych umów cywilnoprawnych. W przypadku świadczenia usług w opisanym wyżej zakresie A działa w charakterze podatnika VAT.

Przepisy ustawy o podatku od towarów i usług (art. 86 ust. 1 oraz art. 86 ust. 2a) wskazują, że podatnik ma prawo do odliczenia podatku VAT od zakupu towarów i/lub usług, które są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych podatkiem VAT (choćby w części). Prawo do odliczenia VAT nie będzie zatem przysługiwało w przypadku, gdy zakup towarów i/lub usług w ogóle (tj. nawet w części) nie ma związku z czynnościami opodatkowanymi VAT. W przypadku realizacji projektów, o których mowa w przedstawionym zdarzeniu przyszłym, A zakupione towary i/lub usługi, będzie wykorzystywał w całości lub w części (w zależności od danego projektu) do wykonywania czynności opodatkowanych VAT. W związku z czym A będzie uprawniony do odliczenia podatku VAT od tych zakupów.

Ustawodawca w art. 88 ustawy o podatku od towarów i usług wymienił przypadki kiedy podatnikowi VAT nie przysługuje prawo do odliczenia VAT.

Art. 88 ust. 3a ustawy VAT enumeratywnie wymienia przypadki kiedy faktura nie uprawnia do odliczenia podatku VAT. I są to następujące sytuacje:

1)sprzedaż została udokumentowana fakturami wystawionymi przez podmiot nieistniejący,

2)transakcja udokumentowana fakturą nie podlega opodatkowaniu albo jest zwolniona od podatku,

3)wystawione faktury:

a)stwierdzają czynności, które nie zostały dokonane - w części dotyczącej tych czynności,

b)podają kwoty niezgodne z rzeczywistością - w części dotyczącej tych pozycji, dla których podane zostały kwoty niezgodne z rzeczywistością,

c)potwierdzają czynności, do których mają zastosowanie przepisy art. 58 i 83 Kodeksu cywilnego - w części dotyczącej tych czynności;

4)faktury, faktury korygujące wystawione przez nabywcę zgodnie z odrębnymi przepisami nie zostały zaakceptowane przez sprzedającego;

5)wystawiono faktury, w których została wykazana kwota podatku w stosunku do czynności opodatkowanych, dla których nie wykazuje się kwoty podatku na fakturze - w części dotyczącej tych czynności.

A realizując projekty, o których mowa w przedstawionym zdarzeniu przyszłym będzie otrzymywać faktury VAT od dostawców towarów i/lub usługodawców. Faktury będą dokumentować czynności związane z działalnością opodatkowaną VAT (w całości lub w części – w zależności od danego projektu).

Zgodnie z umowami o dofinansowanie ww. projektów zawartymi B, a A „wydatki poniesione na podatek od towarów i usług (VAT) są kwalifikowane. W przypadku uznania podatku VAT za kwalifikowany w ramach projektu, kontrola podwójnego finansowania wydatków w odniesieniu do kosztów podatku VAT, możliwego do odzyskania przez Beneficjenta, będzie dokonywana przez właściwe służby skarbowe”.

Z uwagi na fakt iż wartość każdego z ww. projektów jest niższa niż 5 mln EUR, szczegółowe opisy priorytetów programu ani regulamin wyboru projektów nie wyłączyły możliwości kwalifikowania podatku VAT, a umowy o dofinansowanie projektów zawierają zapisy o kwalifikowalności podatku VAT, A wykazywać będzie we wnioskach o płatność składanych do FNP wydatki ponoszone na zakup towarów i usług w ramach ww. projektów w pełnej wysokości.

Ponadto zgodnie z regulacją art. 88 ust. 4 ustawy VAT z prawa do odliczenia podatku VAT skorzystać mogą wyłącznie podatnicy, którzy są zarejestrowani jako podatnicy VAT czynni.

Tak jak wskazano na wstępie A jest podatnikiem zarejestrowanym jako podatnik VAT czynny i składa pliki JPK_V7M za okresy miesięczne.

Podsumowanie:

Mając na uwadze zamiar wykorzystywania nabytych towarów i/lub do świadczenia usług w zakresie odpłatnego udzielenia licencji do wyników badań należy uznać, że ponosząc wydatki w tym zakresie A będzie działać w charakterze podatnika podatku od towarów i usług (VAT). Jeśli zaś chodzi o związek dokonywanych zakupów z wykonywaniem czynności opodatkowanych VAT to również ta przesłanka zostanie spełniona, ponieważ w ocenie A ponoszenie wydatków w ramach projektów przedstawionych w zdarzeniu przyszłym będzie mieć związek z wykonywaniem przez A czynności opodatkowanych VAT w postaci usług w zakresie udzielenia licencji do wyników badań.

Tym samym, stosownie do art. 86 ust. 1 ustawy o VAT, A będzie przysługiwało prawo do odliczenia VAT naliczonego (w całości lub w części) od ponoszonych wydatków związanych z tymi projektami. Ponadto A pragnie podkreślić, że stanowisko odmienne od przedstawionego powyżej pozostałoby w sprzeczności z fundamentalną zasadą opodatkowania VAT, jaką jest zasada neutralności tego podatku. A jest czynnym podatnikiem podatku VAT i jest zobowiązany uiszczać VAT należny z tytułu świadczenia usług w zakresie udzielenia licencji. W związku z czym A powinien mieć zatem jednocześnie prawo do odliczenia VAT naliczonego od wydatków warunkujących możliwość świadczenia tej usługi.

Reasumując, w przypadku ponoszenia wydatków na realizację projektów finansowanych przez B A będzie przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego VAT (w całości lub w części) od wydatków związanych z danym projektem, w sytuacji, gdy nie zaistnieją przesłanki negatywne wynikające z art. 88 ustawy o podatku od towarów i usług, które nie dają prawa do odliczenia podatku naliczonego z faktur zakupowych. Taką przesłanką nie będzie również fakt dokonania płatności na rzecz dostawców i/lub usługodawców za ponoszone wydatki związane z tymi projektami ze środków otrzymanych z B w kwocie brutto (tj. wraz z podatkiem VAT).

Ocena stanowiska

Stanowisko, które przedstawili Państwo we wniosku jest prawidłowe.

Uzasadnienie interpretacji indywidualnej

Zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (t. j. Dz. U. z 2024 r. poz. 361 ze zm.), zwanej dalej „ustawą”:

Stosownie do art. 86 ust. 2 pkt 1 ustawy:

Prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego przysługuje gdy:

• odliczenia dokonuje zarejestrowany czynny podatnik podatku od towarów i usług,
• towary i usługi, z których nabyciem podatek został naliczony, są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych.

Aby skorzystać z prawa do odliczenia podatku naliczonego od towarów i usług zakupionych na potrzeby wykonania określonej czynności, podmiot musi wykonywać tę czynność jako podatnik podatku od towarów i usług, który działa w ramach prowadzonej działalności gospodarczej.

W świetle art. 15 ust. 1 ustawy:

Zgodnie z art. 15 ust. 2 ustawy:

Zasada wyrażona w art. 86 ust. 1 ustawy wyklucza możliwość odliczenia podatku naliczonego związanego z towarami i usługami, które nie są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych, czyli w przypadku ich wykorzystania do czynności zwolnionych od podatku VAT oraz niepodlegających opodatkowaniu.

W każdym przypadku należy dokonać oceny, czy intencją podatnika wykonującego określone czynności, z którymi łączą się skutki podatkowoprawne, było wykonywanie czynności opodatkowanych. Podatnik ma obowiązek dokonania tzw. alokacji podatku, czyli określenia, z jakim rodzajem działalności będzie związany podatek wynikający z otrzymanych faktur zakupu. Obowiązkiem podatnika jest przypisanie konkretnych wydatków do określonego rodzaju sprzedaży, z którymi wydatki te są związane.

Prawo do odliczenia podatku naliczonego przysługuje pod warunkiem, że:

• spełnione zostały przesłanki pozytywne, wynikające z art. 86 ust. 1 ustawy oraz
• nie zaistniały przesłanki negatywne, określone w art. 88 ustawy – pozbawiają one podatnika prawa do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego.

Jedno z takich ograniczeń zostało wskazane w art. 88 ust. 3a pkt 2 ustawy, zgodnie z którym:

Oznacza to, że podatnik nie może skorzystać z prawa do odliczenia w odniesieniu do podatku, który jest należny wyłącznie z tego względu, że został wykazany na fakturze w sytuacji, gdy transakcja nie podlega opodatkowaniu albo jest zwolniona od podatku.

Na podstawie art. 88 ust. 4 ustawy:

Z art. 86 ust. 1 ustawy wynika, że odliczenie podatku naliczonego może być częściowe, tzn. w tej części, w jakiej dane towary lub usługi, z którymi związany jest podatek naliczony, są wykorzystywane do realizacji czynności opodatkowanych. Przy odliczeniu częściowym pomija się tę część podatku, w jakiej zakupione towary i usługi są wykorzystywane do wykonywania czynności nieopodatkowanych podatkiem VAT i zwolnionych z podatku.

Generalną zasadę uprawniającą do odliczenia podatku naliczonego uzupełniają regulacje zawarte w art. 86 ust. 2a i następne oraz art. 90 ustawy.

W świetle art. 86 ust. 2a ustawy:

W oparciu o art. 86 ust. 2b ustawy:

Według art. 86 ust. 2d ustawy:

Stosownie do art. 86 ust. 2g ustawy:

W tym miejscu należy wskazać, że w myśl art. 86 ust. 2h ustawy:

Natomiast z treści art. 86 ust. 22 ustawy wynika, że:

Na podstawie powyższej delegacji, zostało wydane rozporządzenie Ministra Finansów z dnia 17 grudnia 2015 r. w sprawie sposobu określania zakresu wykorzystywania nabywanych towarów i usług do celów działalności gospodarczej w przypadku niektórych podatników (t. j. Dz. U. z 2021 r. poz. 999), zwane dalej rozporządzeniem.

Podatnikami, do których odnoszą się przepisy zawarte w rozporządzeniu, są jednostki samorządu terytorialnego, samorządowe instytucje kultury, państwowe instytucje kultury, uczelnie publiczne, instytuty badawcze.

Stosownie do § 6 rozporządzenia:

Zgodnie z § 8 rozporządzenia:

Prawidłowa wykładnia art. 86 ust. 2a ustawy wymaga zdefiniowania pojęć: „cele wykonywanej działalności gospodarczej” oraz „cele inne niż działalność gospodarcza”.

Cele prowadzonej działalności gospodarczej należy rozpatrywać w kontekście definicji działalności gospodarczej, określonej w art. 15 ust. 2 i ust. 3 ustawy.

W związku z prowadzeniem działalności gospodarczej u podatnika mogą wystąpić działania czy sytuacje, które nie generują opodatkowania podatkiem VAT. Towarzyszą one działalności gospodarczej i nie stanowią obok niej odrębnego przedmiotu działalności podatnika. Nie podlegają one opodatkowaniu podatkiem VAT, ale ich występowanie nie oznacza, że podatnik wykonuje czynności poza działalnością gospodarczą. Za czynności zrównane z czynnościami wykonywanymi w ramach działalności gospodarczej uznaje się także nieodpłatną dostawę towarów lub nieodpłatne świadczenie usług na cele osobiste, w przypadkach, o których mowa w art. 7 ust. 2 i art. 8 ust. 2 ustawy. Chociaż czynności te z definicji nie mają związku z działalnością gospodarczą, następuje obowiązek naliczenia VAT w przypadkach określonych w tych przepisach.

Natomiast przez cele inne rozumie się sferę działalności danego podmiotu niebędącą działalnością gospodarczą w rozumieniu art. 15 ust. 2 i ust. 3 ustawy – przykładowo działalność podmiotu w charakterze organu władzy, czy nieodpłatną działalność statutową.

Art. 86 ust 2a ustawy odnosi się do sytuacji, gdy podatnik nabywa towary i usługi, przeznaczone do wykorzystywania zarówno do celów wykonywanej przez podatnika działalności gospodarczej, jak i do celów innych niż działalność gospodarcza (z określonymi wyjątkami, które przepis ten wskazuje).

Natomiast gdy podatnik w ramach działalności gospodarczej wykonuje czynności opodatkowane podatkiem od towarów i usług oraz zwolnione z opodatkowania, powinien mieć na uwadze uregulowania zawarte w art. 90 ustawy. Stanowią one uzupełnienie przepisów art. 86 ustawy.

Zgodnie z art. 90 ust. 1 ustawy:

Na podstawie art. 90 ust. 2 ustawy:

W myśl art. 90 ust. 3 ustawy:

Na mocy art. 90 ust. 4 ustawy:

Przepisy dotyczące zasad odliczania częściowego, zawarte w art. 90 ustawy, znajdują zastosowanie wyłącznie w odniesieniu do czynności wykonywanych w ramach działalności gospodarczej w rozumieniu ustawy. Zatem dotyczą czynności podlegających opodatkowaniu (opodatkowanych i zwolnionych).

Aby odliczyć podatek naliczony podatnik powinien w pierwszej kolejności przyporządkować ponoszone wydatki do poszczególnych rodzajów działalności:

• opodatkowanej podatkiem VAT,
• zwolnionej od podatku,
• niepodlegającej opodatkowaniu.

W przypadku zakupów bezpośrednio związanych z działalnością opodatkowaną, podatnik, na podstawie art. 86 ust. 1 ustawy, odlicza podatek naliczony w całości. Natomiast w sytuacji, gdy takie przyporządkowanie nie jest możliwe, a wydatki służą zarówno do celów wykonywanej przez podatnika działalności gospodarczej, jak i do celów innych niż działalność gospodarcza, podatnik winien ustalić proporcję, o której mowa w art. 86 ust. 2a ustawy (tzw. prewspółczynnik), a następnie – w przypadku wystąpienia także czynności zwolnionych od podatku – w art. 90 ust. 2 i 3 ustawy (tzw. współczynnik sprzedaży).

Z opisu sprawy wynika, że są Państwo podatnikiem zarejestrowanym jako podatnik VAT czynny -szkołą wyższą (uczelnią publiczną). Otrzymali Państwo z B dofinansowanie na realizację pięciu projektów w ramach (…). Dokonali Państwo oceny możliwości odliczenia podatku VAT w projektach w następujący sposób – z uwagi na pojawienie się potencjału komercjalizacyjnego i zamiaru wykorzystania nabytych towarów i/lub usług do czynności opodatkowanych VAT, oraz również (w niektórych projektach) wykorzystania nabytych do tych projektów towarów i/lub usług do innych czynności, takich jak edukacja i działalność naukowo-badawcza, czyli czynności zwolnione od podatku VAT oraz niepodlegające opodatkowaniu VAT, uznali Państwo, że podatek VAT od nabywanych towarów i/lub usług w ww. projektach, będzie odliczany w całości lub będzie rozliczany według wskaźników VAT (wg prewspółczynnika VAT, o którym mowa w art. 86 ust. 2a ustawy o VAT) i/lub wg struktury sprzedaży, o której mowa w art. 90 ustawy VAT). Faktury dotyczące realizowanych projektów będą wystawiane na Państwa - nabywcę towarów i/lub usług. Towary i usługi nabywane w związku z realizacją projektów będą wykorzystywane (w zależności od projektu) do czynności: opodatkowanych podatkiem od towarów i usług (w zakresie dot. działalności komercyjnej), i/lub zwolnionych od podatku od towarów i usług (w zakresie dot. działalności edukacyjnej), i/lub niepodlegających opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług (w zakresie dot. działalności naukowej). Towary i usługi nabywane w związku z realizacją projektów będą służyły różnym rodzajom działalności i nie ma możliwości przyporządkowania całości kwot podatku naliczonego do poszczególnych rodzajów czynności. Do obliczenia proporcji wybrany zostanie sposób określenia proporcji wskazany w § 6 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 17 grudnia 2015 r. w sprawie sposobu określania zakresu wykorzystywania nabywanych towarów i usług do celów działalności gospodarczej w przypadku niektórych podatników. Do obliczenie tzw. wskaźnika struktury sprzedaży wybrany zostanie sposób określony w art. 90 ust. 2-10 ustawy o podatku od towarów i usług.

Państwa wątpliwości dotyczą ustalenia czy będzie Państwu przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego (w całości lub zgodnie z wyliczonymi wskaźnikami odliczenia VAT) od zakupu towarów i/lub usług w ramach realizowanych projektów.

Przy odliczaniu podatku naliczonego od wydatków poniesionych na realizację projektów w pierwszej kolejności zastosowanie znajdą regulacje art. 86 ust. 2a ustawy przy uwzględnieniu przepisów § 6 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 17 grudnia 2015 r. W dalszej kolejności, będą Państwo zobowiązani dokonać kolejnego podziału podatku naliczonego w oparciu o zasady wskazane w art. 90 ust. 2 i 3 ustawy, tj. zastosować wskaźnik struktury sprzedaży.

Tym samym, będzie Państwu przysługiwało prawo do częściowego odliczenia podatku naliczonego w związku z realizacją projektów w zakresie, w jakim zakupione w ramach projektów towary i usługi będą służyć do wykonywania czynności opodatkowanych podatkiem VAT.

Zatem, Państwa stanowisko w zakresie pytania nr 1 jest prawidłowe.

Państwa wątpliwości dotyczą także ustalenia czy w trakcie realizacji projektów w ramach (...), dokonanie płatności za faktury na rzecz dostawców i/lub usługodawców za ponoszone wydatki związane z tymi projektami, ze środków otrzymanych z B. w kwocie brutto (tj. wraz z podatkiem VAT) będzie przesłanką negatywną wymienioną w art. 88 ustawy o podatku od towarów i usług, która Wnioskodawcy nie daje prawa do odliczenia podatku VAT z faktur zakupu.

Prawo do odliczenia przysługuje pod warunkiem niewystąpienia przesłanek negatywnych wymienionych w art. 88 ustawy. Przy czym z przepisu tego nie wynika ograniczenie prawa do odliczenia podatku naliczonego z uwagi na sposób finansowania dokonywanych przez podatnika zakupów. Taką przesłanką nie będzie również fakt dokonania płatności na rzecz dostawców i/lub usługodawców za ponoszone wydatki związane z projektami ze środków otrzymanych z B w kwocie brutto (tj. wraz z podatkiem VAT).

W konsekwencji, w przypadku ponoszenia wydatków na realizację projektów finansowanych przez B. będzie Państwu przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego VAT (w całości lub w części) od wydatków związanych z danym projektem, w sytuacji, gdy nie zaistnieją przesłanki negatywne wynikające z art. 88 ustawy o podatku od towarów i usług, które nie dają prawa do odliczenia podatku naliczonego z faktur zakupowych.

Tym samym, Państwa stanowisko w zakresie pytania nr 2 jest prawidłowe.

Dodatkowe informacje

Informacja o zakresie rozstrzygnięcia

Interpretacja dotyczy zdarzenia przyszłego, które Państwo przedstawili i stanu prawnego, który obowiązuje w dniu wydania interpretacji.

Pojęcie „kosztu kwalifikowalnego” nie jest pojęciem podatkowym i organy podatkowe nie są właściwe do rozstrzygania wątpliwości podatników odnośnie możliwości zaliczania wartości podatku od towarów i usług do kosztów kwalifikowalnych. Kwestię tę rozstrzygają bowiem przepisy regulujące zasady korzystania ze środków pomocowych. Zasady i przepisy podatkowe przywołane w uzasadnieniu niniejszej interpretacji mogą być jedynie pomocne przy dokonywaniu oceny, czy podatek VAT w tej sytuacji powinien być kosztem kwalifikowalnym. W związku z powyższym nie zająłem stanowiska w tej sprawie.

Pouczenie o funkcji ochronnej interpretacji

• Funkcję ochronną interpretacji indywidualnych określają przepisy art. 14k-14nb ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. – Ordynacja podatkowa (t. j. Dz. U. z 2025 r. poz. 111 ze zm.). Interpretacja będzie mogła pełnić funkcję ochronną, jeśli Państwa sytuacja będzie zgodna (tożsama) z opisem zdarzenia przyszłego i zastosują się Państwo do interpretacji.
• Zgodnie z art. 14na § 1 Ordynacji podatkowej:

·Zgodnie z art. 14na § 2 Ordynacji podatkowej:

Pouczenie o prawie do wniesienia skargi na interpretację

Mają Państwo prawo do zaskarżenia tej interpretacji indywidualnej do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w (...). Zasady zaskarżania interpretacji indywidualnych reguluje ustawa z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (t. j. Dz. U. z 2024 r. poz. 935 ze zm.; dalej jako „PPSA”).

Skargę do Sądu wnosi się za pośrednictwem Dyrektora KIS (art. 54 § 1 PPSA). Skargę należy wnieść w terminie trzydziestu dni od dnia doręczenia interpretacji indywidualnej (art. 53 § 1 PPSA):

• w formie papierowej, w dwóch egzemplarzach (oryginał i odpis) na adres: Krajowa Informacja Skarbowa, ul. Warszawska 5, 43-300 Bielsko-Biała (art. 47 § 1 PPSA), albo
• w formie dokumentu elektronicznego, w jednym egzemplarzu (bez odpisu), na adres Krajowej Informacji Skarbowej na platformie ePUAP: /KIS/wnioski albo /KIS/SkrytkaESP (art. 47 § 3 i art. 54 § 1a PPSA).

Skarga na interpretację indywidualną może opierać się wyłącznie na zarzucie naruszenia przepisów postępowania, dopuszczeniu się błędu wykładni lub niewłaściwej oceny co do zastosowania przepisu prawa materialnego. Sąd jest związany zarzutami skargi oraz powołaną podstawą prawną (art. 57a PPSA).

Podstawa prawna dla wydania interpretacji

Podstawą prawną dla wydania tej interpretacji jest art. 13 § 2a oraz art. 14b § 1 Ordynacji podatkowej.